CURS: Bioinformàtica per a Enginyers |
|
|
|
|
Dates: 18 i 19 de setembre.
Horari: 9.00h a 18.00h (inclou dinar)
Durada: 16h Preu: 310 € (associat) 480 € (no associat)
Lloc: COEIC Via Laietana, 37 2n Barcelona
Inscriu-te a: formacio@telecos.cat – Tel. 935513322
La bioinformàtica tracta d'algorismes i sistemes de computació dedicats a l'anàlisi de grans conjunts de dades d'informació biològica. Des del punt de vista de l'enginyeria, per tant, els biòlegs són els clients i, com a resultat, la pròpia biologia informa de moltes de les decisions que es poden i s'han de fer al dissenyar algoritmes bioinformàtics, pipelines i la seva implementació en recursos de hardware.
Objectiu
Donar els tres elements més essencials en l'aproximació a la bioinformàtica: la base conceptual del lèxic més comú en la biologia moderna, una visió pràctica de la naturalesa, l'abast i el format dels problemes i les dades abordades i visió interactiva dels mètodes, pràctiques i marcs operatius de la biologia moderna. Amb tot aquest conjunt de punts, l'alumne hauria de poder acostar-se a projectes col·laboratius en bioinformàtica, interactuar amb el biòleg per establir associacions, apropar-se a la literatura primària en biomedicina i identificar àrees on buscar més formació en bioinformàtica.
Va adreçat a
Enginyers i científics que es vulguin introduir a participar transversalment de la investigació bioinformàtica.
Ponents
Ivan Erill (coordinador), Julia Ponomarenko, David Torrents, Miguel Ángel Peinado, Eduard Monsó, Gemma Marfany i Cédric Notredame, tot ells especialistes en Bioinformàtica.
Programa
1. Biology as a compunting paradigm: Introduction to molecular biology with a focus on information processing, essential concepts in molecular biology, central dogma, evolution and information processing.
2. Experimental methods in biomedial research: Experimenting design, controls and replicantes, molecular biology and high-throughput methods. Critical reading of molecular biology manuscripts anb team-based discussion; hypothesis, evidence and methods.
3. Essential bioinformatics: Genome assembly, alignment and sequence search; dynamic programming, computacional issues and search strategies, multiple sequence alignment, parallelization. Guided exercices on main bioinformatics repositories, BLAST flavors
4. Microbiome research: Microbiome and hologenome, bacteria in human health and the environment.
4.1. Microbiome research: Metagenomics, concepts and approaches, 16S and deep-sequencing, environmental human microbiome analysis, computacional challenges critital reading of microbiome analysis manuscripts; team-based discussion.
4.2 Cancer biology: Guided exercices on microbiome data analysis. Cancer as a disease, tumor stages, critical pathways, chemo-, radio-, and immunotherapy, metastasis and resistance. Bioinformatics approaches to cancer and therapy. Critial reading of experimental cancer manuscripts using bioinformatics approaches; team-based discussion. guided exercices on cancer data analysis.
|
|
|
|
|